Op het voormalig werkeiland Lelystad-Haven werden vanaf het midden van de jaren 50 gezamenlijk erediensten gehouden. Erediensten in de geest van de polderpioniers: samen iets nieuws beginnen betekent samen op weg gaan.
In Lelystad trokken hervormden en gereformeerden vanaf het begin gezamenlijk – in federatief verband- op. Sinds 1997 tevens met de lutheranen van de Evangelisch Lutherse Gemeente in Flevoland. De Federatie presenteerde zich tot 2005 onder de naam ‘SOW (Samen Op Weg)-kerk Lelystad’. Sinds het landelijk samengaan van deze drie kerken maakt onze kerk als Protestantse Gemeente Lelystad deel uit van de Protestantse Kerk Nederland (PKN).Verbondenheid is er met andere kerken in Lelystad via de plaatselijke Raad van Kerken, het IDO (Interdiaconaal Overleg) en het Pastoresconvent Lelystad (platform van Lelystadse voorgangers).